1953年吉林省煤田地质队伍开始组建。先后为国家地质找矿事业建立了卓越功勋。先后成建制地支援西南贵州和西北青海地质找矿会战（1964年-1972年），同时还参与了东三省及内蒙古等地煤田地质勘探会战。

1954年1月东北煤田地质勘探分局成立，同年6月吉林省各矿务局所属钻探公司改归地质分局领导，各勘探队合并并改为地质勘探大队。

1955年煤炭部成立煤田地质勘探总局，全国136个勘探队由东北开始排号命名，吉林省有102队、203队、112队、第二物测大队、长春煤田地质研究所。

1958年7月9日吉林省煤田地质勘探局在长春正式成立（隶属于吉林省煤炭工业管理局）。

1963年吉林省煤田地质勘探局改称吉林省煤田地质勘探公司，隶属吉林省煤炭工业局。

1983年东煤公司成立，1984年4月吉林煤田勘探公司撤销，成立东北煤田地质局，各地质队直属东北煤田地质局。

1998年吉林煤田地质系统队伍下放地方管理。

1999年吉林省煤田地质局正式成立。

2009年，随着吉林省政府机构改革，煤炭工业局撤销，吉林省煤田地质局划归省能源局管理，为行政副厅级，是省财政一级预算单位。

局机关设行政办公室、机关党委、财务审计处、人事处、规划发展处、地质勘查处、装备管理处、工会等部门。

全局主要负责组织并实施全省煤炭以及煤层气勘查、煤田预测、煤田地质研究工作；负责全省煤田地质系统的资产经营管理和国拨地勘事业费管理；负责制定全省煤田地质发展规划；负责拟定煤田地质系统改革方案，指导其所属单位的改革与发展；承担国家和全省基础性、公益性、战略性地质勘查项目研究工作。

全局具有固体勘查、气体勘查、地球物理、勘查施工等13类48项勘查资质，其中15个甲级、22个乙级、9个丙级，同时具有非开挖和建筑基础2个一级资质。